Anges de Fatima 2-5 Dedebit FC *
| 02.03.2013 | Dedebit FC | 1-2 | Anges de Fatima | |
| 17.02.2013 | Anges de Fatima | 0-4 | Dedebit FC | |
Mogas 90 FC 0-6 AS Douanes (TOG) *
| 02.03.2013 | AS Douanes (TOG) | 3-0 W.O. | Mogas 90 FC | |
| 16.02.2013 | Mogas 90 FC | 0-3 W.O. | AS Douanes (TOG) | |
CS Don Bosco 3-4 SuperSport United *
| 02.03.2013 | SuperSport United | 3-3 | CS Don Bosco | |
| 17.02.2013 | CS Don Bosco | 0-1 | SuperSport United | |
*Azam FC 8-1 El Nasir FC
| 03.03.2013 | El Nasir FC | 0-5 | Azam FC | |
| 16.02.2013 | Azam FC | 3-1 | El Nasir FC | |
*BYC FC 1-0 FC Johansen
| 03.03.2013 | FC Johansen | 0-0 | BYC FC | |
| 17.02.2013 | BYC FC | 1-0 | FC Johansen | |
Gaborone United 2-3 Liga Muçulmana *
| 02.03.2013 | Liga Muçulmana | 1-0 | Gaborone United | |
| 16.02.2013 | Gaborone United | 2-2 | Liga Muçulmana | |
*Gor Mahia 5-0 Anse Réunion
| 02.03.2013 | Anse Réunion | 0-5 | Gor Mahia | |
| 16.02.2013 | Gor Mahia | 0-0 | Anse Réunion | |
*Nasr Benghazi 1-0 Khartoum Al Watani
| 03.03.2013 | Khartoum Al Watani | 0-1 | Nasr Benghazi | |
| 17.02.2013 | Nasr Benghazi | 0-0 | Khartoum Al Watani | |
New Edubiase United 1-1 Diables Noirs *
| 02.03.2013 | Diables Noirs | 1-0/p.5-4 | New Edubiase United | |
| 17.02.2013 | New Edubiase United | 1-0 | Diables Noirs | |
Stella Club 1-4 Onze Créateurs *
| 03.03.2013 | Onze Créateurs | 3-0 | Stella Club | |
| 16.02.2013 | Stella Club | 1-1 | Onze Créateurs | |
*Panthère du Ndé 3-1 Elect Sport FC
| 03.03.2013 | Elect Sport FC | 1-1 | Panthère du Ndé | |
| 16.02.2013 | Panthère du Ndé | 2-0 | Elect Sport FC | |
*LLB S4 Africa 2-1 Police FC (RWA)
| 02.03.2013 | Police FC (RWA) | 1-1 | LLB S4 Africa | |
| 17.02.2013 | LLB S4 Africa | 1-0 | Police FC (RWA) | |
Power Dynamos 1-2 Recreativo Caála *
| 03.03.2013 | Recreativo Caála | 2-0 | Power Dynamos | |
| 17.02.2013 | Power Dynamos | 1-0 | Recreativo Caála | |
*Rail Club Kadiogo 2-1 Sahel SC Niamey
| 02.03.2013 | Sahel SC Niamey | 0-1 | Rail Club Kadiogo | |
| 16.02.2013 | Rail Club Kadiogo | 1-1 | Sahel SC Niamey | |
*TCO Boeny 3-3 Mbabane Highlanders
| 02.03.2013 | Mbabane Highlanders | 1-2/p.3-5 | TCO Boeny | |
| 17.02.2013 | TCO Boeny | 1-2 | Mbabane Highlanders | |
*The Panthers 3-0 FC Séquence
| 03.03.2013 | FC Séquence | 0-2 | The Panthers | |
| 17.02.2013 | The Panthers | 1-0 | FC Séquence | |
Unisport Bafang 0-3 US Bougouni *
| 02.03.2013 | US Bougouni | 2-0 | Unisport Bafang | |
| 17.02.2013 | Unisport Bafang | 0-1 | US Bougouni | |
Desportivo de Guadalupe 1-17 US Bitam *
| 02.03.2013 | US Bitam | 12-1 | Desportivo de Guadalupe | |
| 17.02.2013 | Desportivo de Guadalupe | 0-5 | US Bitam | |